Ce trebuie să știți
- Un fișier FNA este un fișier de aliniere a secvenței de proteine și ADN în format FASTA.
- Deschide unul cu Geneious.
- Conversie la FASTA și formate similare cu același program.
Acest articol explică ce este un fișier FNA, cum să deschideți unul și cum să salvați unul într-un alt format, cum ar fi FASTA, GB, VCF, imagini etc.
Ce este un fișier FNA?
Un fișier cu extensia de fișier FNA este un fișier FASTA Format DNA and Protein Sequence Alignment care stochează informații ADN care pot fi utilizate de software-ul de biologie moleculară.
Fișierele FNA, în special, pot fi folosite pentru a păstra doar informații despre acizii nucleici, în timp ce alte formate FASTA conțin alte informații legate de ADN, cum ar fi cele cu FASTA, FAS, FA, FFN, FAA, FRN, MPFA, SEQ extensii de fișiere, NET sau AA.
Aceste formate FASTA bazate pe text au apărut inițial dintr-un pachet software cu același nume, dar acum sunt utilizate ca standard în aplicațiile de aliniere a secvenței de ADN și proteine.
FNA se referă, de asemenea, la unii termeni tehnologici care nu au nimic de-a face cu acest format de fișier, cum ar fi acceptarea finală a rețelei, facilitatea de creștere a numelui fișierului/atributelor, arhitectura de rețea Fujitsu și anunțul rapid pentru vecin.
Cum se deschide un fișier FNA
Deschide unul în Windows, macOS și Linux cu Geneious (este gratuit timp de 14 zile). Pentru a face acest lucru, navigați la Fișier > Import și alegeți să importați fișierul prin Din fișierelement de meniu.
De asemenea, puteți deschide unul cu BLAST Ring Image Generator (BRIG).
Încercați Notepad++ sau alt editor de text dacă acele idei nu funcționează. Fișierul poate fi într-adevăr bazat pe text și ușor de citit, sau s-ar putea să descoperi că nu are nimic de-a face cu formatul FASTA, caz în care deschiderea fișierului ca document text poate dezvălui text care identifică ceea ce a fost folosit pentru a crea fișierul sau în ce format este fișierul.
Cum se convertesc un fișier FNA
Nu putem verifica acest lucru, deoarece nu am încercat, dar ar trebui să puteți utiliza Geneious pentru a converti fișierul în multe alte formate, cum ar fi FASTA, GB, GENEIOUS, MEG, ACE, CSV, NEX, PHY, SAM, TSV și VCF. Acest lucru se poate face prin meniul Fișier > Export al programului.
Același program ar trebui să poată salva fișierul în PNG, JPG, EPS sau PDF, prin Fișier > Salvare ca fișier imagine.
Deși, în mod normal, nu puteți redenumi extensia unui fișier cu altceva și vă așteptați să funcționeze în același mod, puteți redenumi un fișier. FNA într-un fișier. FA dacă software-ul dvs. de secvențiere ADN va recunoaște doar formatul FA.
În loc să redenumiți extensiile de fișiere, veți dori să utilizați un convertor de fișiere gratuit pentru a converti alte tipuri de fișiere. În cazul fișierelor FNA și FA, se întâmplă ca unele programe să deschidă doar fișiere care au extensia de fișier FA, caz în care redenumirea ar trebui să funcționeze bine.
Încă nu îl puteți deschide?
Dacă, după ce ați folosit programele de mai sus, tot nu puteți deschide fișierul, este posibil să descoperiți că extensia de fișier nu citește de fapt. FNA, ci ceva care arată pur și simplu similar.
De exemplu, fișierele FNG (Font Navigator Group) arată foarte mult ca și cum spun „. FNA”, dar dacă te uiți cu atenție, doar primele două litere sunt aceleași. Deoarece extensiile de fișiere sunt diferite, este o indicație că acestea au un format de fișier diferit și, cel mai probabil, nu vor funcționa cu aceleași programe.
Același lucru s-ar putea spune și pentru multe alte extensii de fișiere, cum ar fi FAX, FAS (AutoLISP Compiled Fast-Load), FAT, FNTA (Aleph One Font), FNC (Vue Functions) și FND (Windows Saved Search).
Ideea aici este să vă asigurați că extensia de fișier citește. FNA. Dacă se întâmplă, încercați din nou să utilizați programele de mai sus pentru a-l deschide sau converti. Dacă aveți un alt tip de fișier, cercetați extensia acestuia pentru a afla ce aplicații sunt necesare pentru a-l deschide sau converti.
Întrebări frecvente
Cum deschideți un fișier FNA în Python?
În primul rând, convertiți fișierul FNA în format FASTA utilizând o aplicație terță parte, cum ar fi Geneious. Apoi, puteți descărca Biopython, un set de instrumente disponibile gratuit pentru calcul biologic pentru munca în bioinformatică. În cele din urmă, consultați tutorialul și cartea de bucate Biopython pentru instrucțiuni despre lucrul cu fișierele FASTA.
Cum îmi găsesc numerele FNA maker într-un fișier brut Ancestry?
Puteți descărca majoritatea datelor ADN de pe Ancestry.com în format.txt. Cu toate acestea, numai clienții al căror ADN a fost analizat cu secvențierea de generație următoare (NGS) au opțiunea de a descărca un fișier VCF. Pentru a descărca un fișier VCF, trebuie să fiți proprietarul ADN, să aveți testat ADN folosind tehnologia NGS și să aveți cel puțin 350 MB de spațiu disponibil pe dispozitiv.
