Fișier PDB (ce este și cum se deschide unul)

Cuprins:

Fișier PDB (ce este și cum se deschide unul)
Fișier PDB (ce este și cum se deschide unul)
Anonim

Ce trebuie să știți

  • Unele fișiere PDB sunt fișiere de baze de date de programe.
  • Deschide unul cu un editor de text sau un program precum Geneious.
  • Conversie într-un alt format cu același program care deschide fișierul de bază de date specific.

Acest articol explică ce este un fișier PDB, cum să deschideți unul și cum să îl convertiți într-un alt format.

Ce este un fișier PDB?

Un fișier cu extensia de fișier PDB este cel mai probabil un fișier de bază de date de program care este folosit pentru a păstra informații de depanare despre un program sau modul, cum ar fi un fișier DLL sau EXE. Uneori sunt numite fișiere cu simboluri.

Fișierul mapează diferite componente și instrucțiuni din codul sursă la produsul final compilat, pe care depanatorul îl poate folosi apoi pentru a găsi fișierul sursă și locația din executabil în care ar trebui să oprească procesul de depanare.

Unele fișiere PDB pot fi în schimb în formatul de fișier Protein Data Bank. Acestea sunt fișiere text simplu care stochează coordonatele privind structurile proteinelor.

Alte fișiere PDB pot fi create în baza de date Palm sau în formatul de fișier PalmDOC și utilizate cu sistemul de operare mobil PalmOS; unele fișiere în acest format folosesc în schimb extensia de fișier. PRC. Un alt format care folosește aceeași extensie este Tanida Demo Builder.

Image
Image

Cum se deschide un fișier PDB

Diferitele programe folosesc propriul fișier PDB pentru a stoca date într-un fel de format de bază de date structurată, astfel încât fiecare aplicație este folosită pentru a-și deschide propriul tip.

Geneious, Quicken, Visual Studio și Pegasus sunt doar câteva exemple de programe care ar putea folosi fișierul ca fișier de bază de date. Ar putea funcționa și radare și PDBparse.

Unele fișiere PDB sunt stocate ca text simplu, cum ar fi fișierele Geneious Program Debug Database și sunt complet lizibile de om dacă sunt deschise într-un editor de text. Puteți deschide acest tip de fișier PDB cu orice program care poate citi documente text, cum ar fi programul Notepad încorporat în Windows. Alte programe de vizualizare și editoare compatibile includ Notepad++ și Brackets.

Alte fișiere PDB nu sunt documente text și sunt utile numai atunci când sunt deschise cu programul pentru care este destinat. De exemplu, dacă al tău are legătură într-un fel cu Quicken, atunci încearcă să folosești acel software pentru a-l vizualiza sau edita. Visual Studio se așteaptă să vadă un fișier PDB în același folder cu fișierul DLL sau EXE.

Puteți vizualiza și edita fișierele Protein Data Bank în Windows, Linux și macOS cu Avogadro. Aceste programe pot deschide și fișierul: Jmol, RasMol, QuickPDB și USCF Chimera. Deoarece acestea sunt text simplu, puteți deschide unul și într-un editor de text.

Palm Desktop ar trebui să poată deschide acest fișier dacă este în formatul de fișier Palm Database, dar mai întâi ar trebui să-l redenumiți pentru a avea extensia de fișier PRC pentru ca programul respectiv să-l recunoască. Calibru este o altă opțiune.

Pentru a deschide un fișier PalmDOC PDB, încercați STDU Viewer.

Tanida Demo Builder deschide fișiere în formatul respectiv.

Cum se convertește un fișier PDB

Fișierele bazei de date de programe nu pot fi convertite într-un alt format de fișier, cel puțin nu cu un instrument obișnuit de conversie a fișierelor. În schimb, dacă există vreo aplicație care poate converti acest tip de fișier, ar fi același program care o poate deschide.

De exemplu, dacă trebuie să convertiți fișierul bazei de date din Quicken, încercați să utilizați acel program pentru a face acest lucru. Cu toate acestea, acest tip de conversie este probabil nu numai de puțin folos, ci și nu este acceptat în aceste aplicații de baze de date (adică, probabil că nu trebuie să convertiți acest tip de fișier PDB în alt format).

Fișierele Protein Data Bank pot fi convertite în alte formate cu MeshLab. Pentru a face acest lucru, poate fi necesar să-l convertiți mai întâi în WRL cu PyMOL din Fișier > Salvați imaginea ca > VRML meniul , apoi importați fișierul WRL în MeshLab și utilizați Fișier > Exportați meniul Mesh ca pentru a converti fișierul PDB în cele din urmă STL sau alt format de fișier.

Dacă nu aveți nevoie ca modelul să fie color, puteți exporta fișierul direct în STL cu USCF Chimera (linkul de descărcare este mai sus). În caz contrar, puteți utiliza aceeași metodă ca mai sus (cu MeshLab) pentru a converti PDB în WRL cu USCF Chimera și apoi exportați WRL în STL cu MeshLab.

Pentru a converti PDB în PDF sau EPUB, dacă aveți un fișier PalmDOC, este posibil în mai multe moduri, dar cel mai ușor este probabil să utilizați un convertor online precum Zamzar. Puteți încărca fișierul pe site-ul respectiv pentru a avea opțiunea de a-l converti în acele formate, precum și în AZW3, FB2, MOBI, PML, PRC, TXT și în alte formate de fișiere de cărți electronice.

Pentru a converti unul în format FASTA se poate face cu convertorul online PDB în FASTA al Meiler Lab.

Este, de asemenea, posibil să salvați acest fișier în CIF (format de informații cristalografice) online, folosind PDBx/mmCIF.

Încă nu îl puteți deschide?

Fișierele care nu se deschid cu niciunul dintre instrumentele de mai sus, probabil că nu sunt de fapt fișiere PDB. Ceea ce s-ar putea întâmpla este că citiți greșit extensia fișierului; unele formate folosesc un sufix care seamănă foarte mult cu PDB, atunci când nu au nicio legătură și nu funcționează la fel.

De exemplu, un fișier PDF este un fișier document, dar majoritatea programelor de mai sus nu vor reda corect textul și/sau imaginile dacă încercați să deschideți unul cu aceste programe software. Același lucru este valabil și pentru alte fișiere cu extensii de fișiere scrise în mod similar, cum ar fi fișierele DBF, DB, ADP, PD, PDE, PDC, PDO și WPD.

PBD este un altul care aparține programului EaseUS Todo Backup și, prin urmare, este util numai atunci când este deschis cu acel software.

Dacă nu aveți un fișier PDB, căutați extensia de fișier pe care o are fișierul dvs., astfel încât să puteți găsi programul potrivit care îl deschide sau îl convertește.

Citire avansată pe fișiere PDB

Puteți citi mult mai multe despre fișierele bazei de date de programe din GitHub și Wintellect.

Există mai multe de învățat și despre fișierele Protein Data Bank; vezi Banca mondială de date despre proteine și RCSB PDB.

Întrebări frecvente

  • Cum pot remedia problema când Visual Studio nu poate găsi sau deschide fișiere PDB? Dacă vedeți un mesaj care spune că Visual Studio nu poate găsi sau deschide fișierul PDB, încercați folosind instrumentul de depanare al Visual Studio. Accesați Instrumente > Opțiuni > Depanare > Simboluri șiselectați Microsoft Symbol Servers
  • Cum deschid un fișier PDB pe Android? Pentru a deschide un fișier PDB pe Android, utilizați un cititor de fișiere terță parte. Descărcați aplicația Cool Reader sau orice alt cititor acceptat de fișiere PDB de pe Google Play.

Recomandat: